Pelayanan farmasi RSU Muhammadiyah Ponorogo merupakan bagian yang tidak terpisahkan dari pelayanan kesehatan di rumah sakit. Pelayanannya meliputi penyediaan, pengadaan, peracikan dan pendistribusian seluruh perbekalan farmasi yang digunakan di rumah sakit.

RSUMP melayani farmasi klinis dengan didukung Apoteker dan tenaga farmasi yang kompeten dan sistem komputerisasi yang memadai sehingga membuat layanan yang diberikan lebih cepat dan tepat sesuai respon time yang berlaku.